A arquitetura do Honden é definida pelo seu icônico estilo Nagare-zukuri (fluindo), apresentando um telhado curvo assimétrico que se estende para a frente para abrigar a varanda sagrada. Seu telhado de casca de cipreste desgastada e suas juntas de madeira interligadas demonstram o antigo artesanato japonês projetado para proteger a tríade interna de santuários sem usar um único prego.