As impressionantes pedras pretas em Koh Kham são rochas vulcânicas basálticas, remanescentes de uma antiga cratera ativa há milhões de anos. O processo começou com uma erupção vulcânica, onde o magma derretido subiu e surgiu como lava. Ao entrar em contato com o ar e a água do mar, sofreu resfriamento rápido, solidificando-se em uma rocha densa e escura. Ao longo de milênios, a erosão e o intemperismo do vento e das marés desgastaram a estrutura do vulcão, deixando apenas essas pedras duráveis espalhadas pela costa. À medida que os níveis do mar se estabilizaram, o crescimento de corais floresceu ao redor das rochas submersas, criando o jardim subaquático visto hoje.